中国的书院制度萌芽于唐，完备与宋，废止于清，前后千余年的历史。古时，书院是实施藏书、教学与研究三结合的高等教育机构。

北宋真宗大中祥符年间，处士侯遗在茅山郁岗峰前创建茅山书院，并在此收徒授学。至仁宗年间，由当地知府王随上书并向朝廷推荐茅山书院，后书院获赐官田，以作教学经费。由此，茅山书院与岳麓书院等并列为北宋六大书院，前后绵延200余年。

近年来，国家大力弘扬中华传统文化，以构建社会主义核心价值体系。道教是我国固有的传统宗教，在中华文化几千年的发展过程中，始终是重要的参与者、传承者和贡献者，道教文化是中华文化的重要组成部分。积极倡导、践行社会主义核心价值观，为实现中华民族的伟大复兴贡献力量，是道教义不容辞的责任与义务。

茅山乾元观是一座已有两千多年历史的道教名观，自秦朝至今，道脉绵延，高道倍出，文化底蕴深厚，素有“秦汉神仙府，梁唐宰相家”之美誉。

2012年10月，乾元观复建茅山书院并正式揭牌，聘请50余位教内高道以及国内外的专家、学者为书院顾问及研究员。而后，茅山书院以书籍形式对乾元观的历史道脉进行了初步整理。同时，为了让更多的国人了解、喜欢传统文化与道教文化，茅山书院以体道班的形式开班授课，至2016年，已连续成功举办七期养生体道班和二期少儿修学班。

未来，茅山书院将作为乾元观进行深入挖掘、整理、传承和宣扬道教文化的核心所在。